Если багажник дребезжит - значит, где-то металл соприкасается с металлом, причем нежестко, а этого быть не должно.
Может дребезжать в замке. Это решается установкой резиновых отбойничков из мягкой резины (мне понравилась пенорезина), высота подбирается так, чтобы багажник закрывался с легким усилием, но не свободно. Ставить лучше по углам крышки. Если крышка станет выпирать (хотя не должна, если не переборщить с толщиной), отрегулировать ее положение замком и, соответственно, толщиной резинок.
Если крышка багажника где-то касается крыла или еще чего - надо отрегулировать положение крышки, так быть не должно хотя бы для сохранения ЛКП.
Могут дребезжать торсионы. Сам не делал, но думаю, помогут шланги из пенорезины (видел такие), надетые на прутки. Хотя нормально натянутые торсионы дребезжать не должны.
Ну и конечно, незакрученные болты - гайки.